UAT - Diagnostic molecular
GINYS-VHIR-004
Rosario M Prieto Sánchez
Cap d'Unitat
Ofereix la possibilitat de realitzar estudis exhaustius, inclòs l'assessorament inicial sobre disseny experimental; extracció d'ARN, quantificació i control de qualitat inicial; processament de matrius i anàlisi bioinformàtica dels resultats.
Recursos i documentació adicional
La Unitat d'Alta Tecnologia (UAT) és el nucli-instal·lació preclínica del VHIR que ofereix als investigadors equipaments d'última generació i assessorament tècnic especialitzat, oferint diferents serveis dins de les seves cinc Plataformes (Genòmica, Citometria, Diagnòstic Molecular, Metabolòmica i Microscòpia) :
Aquesta plataforma pretén oferir a la comunitat científica serveis i protocols relacionats amb la genòmica funcional, principalment dedicats al perfil de l'expressió gènica mitjançant microarrays: Aquesta plataforma es complementa amb els serveis de la nostra plataforma de genòmica, tant per a l'anàlisi quantitativa i qualitativa d'àcids nucleics com per a la validació dels resultats obtinguts per qPCR.
Serveis
- Estudis d’expressió gènica diferencial
- Perfil de miRNAs i altres ARN no codificants
- Altres aplicacions (per exemple, matrius de genotipat) estan disponibles a petició.
Com que aquests estudis solen ser complexos, recomanem als investigadors que es posin en contacte amb nosaltres abans d’iniciar el projecte, per discutir el millor enfocament experimental inclosa una cotització individualitzada.
Equipament
La plataforma ofereix dos sistemes per processar matrius Thermo Fisher (Affymetrix) :
- Sistema GeneChip per a matrius de cartutxos individuals. Inclou dos forns d’hibridació, dues estacions fluídiques i un escàner 3000 7G amb carregador automàtic, acoblat a una estació de treball controlada pel programari Affymetrix® GeneChip® Command Console® (AGCC). Aquest equip permet processar matrius tant d’expressió com de citogenètica (detecció de SNPs i CNV).
- Instrument GeneTitan MC per a plaques array (format 16x, 24x i 96x) . Es tracta d’un sistema semi-robotitzat que combina hibridació d’objectius, processament de fluids i escaneig de matrius en un sol instrument. Això permet augmentar el rendiment i millorar la reproductibilitat, en reduir la variabilitat tècnica introduïda pel processament manual. L’instrument GeneTitan permet processar plaques d’expressió, genotipat i estudis de microbioma.
