Tecnologies de proteïnes
GINYS-CRG-003
La unitat de tecnologies de cribratge biomolecular i proteïnes (BMS&PT) ofereix als investigadors del CRG-CNAG/PRBB, institucions externes i empreses privades una nova plataforma tecnològica d'alta qualitat per dur a terme la producció de proteïnes i processos automatitzats en el context d'assajos de cribratge biomolecular i bioquímic.
Mitjançant la detecció assistida pel personal, els usuaris tindran accés als equips de la instal·lació, inclosos els manipuladors de líquids, els lectors de plaques i les biblioteques de petites molècules.
A més, la unitat té com a objectiu donar suport als investigadors de l'institut CRG mitjançant la compra, la recerca i el manteniment d'estocs valuosos de clons i soques.
Serveis
- Producció de servei complet de clons de plasmidis, mutants i biblioteques de plasmidis.
- Clonació d’alt rendiment
- Producció de proteïnes recombinants i complexos proteics: bacteris, cèl·lules d’insectes i expressió de mamífers
- Purificació de proteïnes i anticossos
- Caracterització biofísica de proteïnes i àcids nucleics:
- Ressonància plasmònica superficial, termoforesi a microescala, cromatografia d’exclusió de mida – dispersió de llum multiangle
- Automatització d’assajos de cribratge biomolecular i bioquímic
- Edició del genoma mitjançant el sistema Crispr-Cas9: enginyeria de línies cel·lulars de gen knockout/Knockin en col·laboració amb la Unitat d’Enginyeria de Teixits del CRG
Equipament
- ÄKTA Xpress twin i sistema ÄktaFPLC per a la purificació de proteïnes (GE Healthcare)
- Biacore T100 (SPR)
- Monolith NT.115 Termoforesi (MST)
- UPLC (shimatzu) – DAWN8+ Optilab® T-rEX™
- LabCHIP GXII
- Plataforma robòtica TECAN Freedom evo 200
- Plataforma robòtica Caliper Zephyr
- Plataforma robòtica Caliper Sciclone
- Rentadora Biotek ELx405
- Incubadora Kendro
- MultidropV2
- Lector de plaques Tecan M200
- Electroporador Amaxa placa de 96 pous
Biblioteques de siRNA
La col·lecció de genoma sencer humà siGENOME SMARTPoool, (Dharmacon, Thermo-Fisher) es compon de grups de 4 siRNA diferents per gen i es distribueix en quatre “conjunts” de la següent manera
- Kinases – 779 gens
- GPCR – 516 gens
- Genoma “drogable”: 6022 gens
- Col·lecció de genoma restant: 13803 gens
Biblioteques de compostos químics
- The Prestwick Chemical Library®: 1200 molècules petites, 100% medicaments comercialitzats
- Biblioteca Fitoquímica de Prestwick – 320 productes naturals
- Caixa d’eines d’inhibidors de la cinasa de Tocris (Tocris): 80 compostos de molècules petites
Projectes
Títol:
EPIC-XS: Proteomics (2019-2022)
Referència:
https://epic-xs.eu/
Organisme finançador:
EU
Estat:
Actiu
Títol:
ARBRE: L'associació de recursos per a la investigació biofísica a Europa
Referència:
https://arbre-mobieu.eu/
Organisme finançador:
COST-UE
Estat:
Actiu
Publicacions
Multiplex Antibody Analysis of IgM, IgA and IgG to SARS-CoV-2 in Saliva and Serum From Infected Children and Their Close Contacts
Frontiers In Immunology. 13 (751705): 751705-751705 - 2022-01-27 13(751705),
Frontiers In Immunology. 13 (751705): 751705-751705 - 2022-01-27 13(751705),
Determinants of early antibody responses to COVID-19 mRNA vaccines in a cohort of exposed and naïve healthcare workers
Ebiomedicine. 75 - 2022-01-01 75()
Ebiomedicine. 75 - 2022-01-01 75()
Matrix-screening reveals a vast potential for direct protein-protein interactions among RNA binding proteins
Nucleic Acids Research. 49 (12): 6702-6721 - 2021-07-09 49(12)
Nucleic Acids Research. 49 (12): 6702-6721 - 2021-07-09 49(12)
Immunogenicity and crossreactivity of antibodies to the nucleocapsid protein of SARS-CoV-2: utility and limitations in seroprevalence and immunity studies
Transl Res. 23260-74 - 2021-06-01 232()
Transl Res. 23260-74 - 2021-06-01 232()
A multiplex antigen microarray for simultaneous IgG and IgM detection against SARS-CoV-2 reveals higher seroprevalence than reported
Microbial Biotechnology. 14 (3): 1228-1236 - 2021-05-01 14(3)
Microbial Biotechnology. 14 (3): 1228-1236 - 2021-05-01 14(3)