Supercomputació (HPC)
DC, IGTP
Edifici Muntanya
Carretera de Can Ruti, Camí de les escoles, s/n
08916 Badalona, Barcelona, Spain
Serveis
Manteniment i suport de la instal·lació
- Garantir que la infraestructura informàtica funcioni les 24 hores del dia
- Instal·lació i gestió del sistema operatiu (GNU/Linux) a totes les màquines de l’àrea de la informàtica científica
- Instal·lació i gestió del sistema de clústers per a l’àrea de computació científica
- Instal·lació, manteniment i actualització de programari científic
- Gestió de la infraestructura de discs de l’àrea científica
- Gestió de la infraestructura de xarxa dels equipaments científics
- Gestió de la infraestructura de còpia de seguretat i estratègia de recuperació de dades
Instal·lació i gestió de diversos servidors i serveis
(incloent però no limitats a:)
- Servidors web privats i públics i gestió i instal·lació de serveis
- Instal·lació, gestió de bases de dades
- Serveis FTP(S).
- Sistema de control de versions intern (gitlab)
- Eines de monitorització per a l’ajustament del rendiment i alertes
- Sistema de cues (SGE)
Seguretat del sistema (enfortiment, auditoria, pegats)
Assessorament als bioinformàtics en tasques computacionals
- Informàtica d’alt rendiment
- Assessorar i ajudar en el disseny de pipelines bioinformàtics
- Assessorament en la compra de maquinari per a bioinformàtica
Accés obert al portal de bioinformàtica
Accés obert a les eines desenvolupades per l’IGTP
Eines de Maplab (plotter de metilació, ontologia d’Alu, wanderer, Chainy, trackhub TrukeTCGA 450k)
Equipament
El DC té un sistema de ventilació de rotació amb redundància incorporada, també disposa d’un SAI capaç de mantenir el subministrament elèctric de tots els servidors durant diversos minuts (30+) i múltiples línies d’alimentació per a cada bastidor. Com a protecció contra incendis, el CPD disposa d’un sistema automàtic d’extinció de gas trifluorometà.
- Clúster de càlcul
16 nodes de càlcul que donen un total de:
240 nuclis
2 Tb de RAM
TB d’emmagatzematge local (1 TB/node)
Format per tres tipus diferents de nodes:
HP DL160 G6: 8 Nuclis (Xeon E5640) i 64 GB de RAM (x8)
Fujitsu RX200 S7: 12 nuclis (Xeon E5-2640) i 120 GB de RAM (x3)
HP DL 360 G9: 28 nuclis (Xeon E5-2680 v4) i 256 GB de RAM (x5)
- Sistema d’emmagatzematge
El sistema d’emmagatzematge principal és un Isilon (Dell/EMC) Gen 6 d’alta disponibilitat amb quatre nodes H400 i quatre nodes A200.
Capacitat d’emmagatzematge útil 450 Tb Sistema d’instantània disponible per als usuaris
Sistema d’instantànies accessibles per als usuaris
El sistema proporciona un sistema de fitxers unificat per a tots els usuaris i disponible des dels nodes de càlcul o des de les estacions de treball, simplificant el treball dels investigadors.
- Còpia de seguretat/recuperació de dades
El sistema de còpia de seguretat/recuperació de dades està format per:
Biblioteca HPE 4048 amb dues unitats LTO-7 i capacitat per a 48 cintes (capacitat de 768 Tbs)
Quantum Scalar i80 dues unitats LTO-5 amb capacitat per a 50 cintes Ambdues biblioteques estan gestionades pel programari de còpia de seguretat de Bacula
La biblioteca principal (HPE 4048) és per a còpies de seguretat de dades per a grups, màquines virtuals, bases de dades i dades emmagatzemades a llarg termini.
La biblioteca secundària (Quantum Scalar i80) tracta de còpies redundants de màquines virtuals i treballs arxivats en cinta LTO-5.
El sistema fa còpies de seguretat diàries de les dades i amb una política predeterminada de retenció de dades de 3 mesos. Els treballs de còpia de seguretat de l’arxiu es mantenen indefinidament.
- Xarxa
La xarxa de CC està formada per 3 commutadors d’1 Gb 3com 4210G i 3 commutadors de 10 Gb HPE 5700. Els commutadors i connexions a les màquines estan configurats per a una alta disponibilitat. El sistema d’emmagatzematge Isilon, el sistema de còpia de seguretat principal i els nodes de càlcul DL 360 estan connectats a través de 10 GB, la resta del clúster utilitza 1 Gb amb interfícies agregades
