Single Cell (Cèl·lula única)
IJC Building
Ctra. de Can Ruti
Cami de les Escoles s/n 08916 Badalona Barcelona, Spain
La unitat de cèl·lula única està equipada amb instruments d'última generació per a l'aïllament d'una cèl·lula i la preparació de biblioteques. Som una unitat de suport científic i tecnològic per a projectes d'investigació d'alt nivell en l'àmbit de la Genòmica Cel·lular Single i assistirem als investigadors des del disseny experimental fins a l'anàlisi de dades.
LA NOSTRA MISSIÓ
La missió de la Unitat de Cèl·lula Única és facilitar la investigació acadèmica oferint serveis basats en tecnologies d'avantguarda unicel·lular i de genòmica espacial. La genòmica unicel·lular representa una eina poderosa per a l'anàlisi de teixits complexos i ha avançat significativament el nostre coneixement en ciències bàsiques i clíniques. La Unitat Single Cell donarà suport a la comunitat científica mitjançant la tecnologia més avançada per a l'anàlisi unicel·lular.
Serveis
- Oferim suport científic i tecnològic per a projectes d’investigació d’alt nivell en l’àmbit de la seqüenciació cel·lular única segons procediments estàndards internacionals.
- Donem assessorament científic als investigadors, des de la planificació i optimització de nous experiments fins a la seva execució i anàlisi bioinformàtica.
- Contribuïm al foment de la innovació en tecnologies sanitàries i a la transferència del coneixement generat al SNS.
Equipament
10x Genomics Chromium™ System (10x genòmica)
La unitat està equipada amb un instrument Chromium Controller. Aquesta tecnologia es basa en la microfluídica i permet la generació en paral·lel de particions unicel·lulars o de nuclis amb codis de barres identificadors i la preparació de biblioteques de seqüenciació.
– Expressió gènica del transcriptoma 3′ unicel·lular
– Crom Single Cell ATAC (assaig per a la cromatina accessible a la transposasa)
– Multioma monocel·lular de crom ATAC + Expressió gènica
Transcriptòmica espacial – Visium (genòmica 10x)
10x Genomics ha desenvolupat un flux de treball per seqüenciar l’ARNm sense la pèrdua d’informació espacial. La solució d’expressió gènica espacial de Visium permet un transcriptoma complet i una anàlisi dirigida de l’ARNm mitjançant la seqüenciació d’alt rendiment i, posteriorment, mapeja el patró d’expressió d’una transcripció en seccions de teixit mitjançant imatges de microscopi d’alta resolució.
Plataforma Tapestri (Mission Bio)
La plataforma Tapestri està dissenyada per a una seqüenciació unicel·lular dirigida. La plataforma està dissenyada per produir biblioteques de seqüenciació d’ADNc dirigides soles o en una solució multiòmica que combina anàlisis d’ADN i proteïnes unicel·lulars dirigides. Mission Bio ofereix la possibilitat d’utilitzar panells d’ADN i proteïnes predissenyats o personalitzats.
-Seqüenciació d’ADN dirigida a una sola cèl·lula Tapestri
-Seqüenciació d’ADN + Proteïna dirigida unicel·lular Tapestri
Anàlisi de dades
La genòmica unicel·lular i espacial permet la caracterització integral de les cèl·lules en la seva identitat i funció. Tanmateix, les dades d’una sola cèl·lula són sorolloses i presenten diversos reptes computacionals i analítics, que requereixen l’aplicació d’eines dissenyades específicament per a la seva anàlisi. La unitat donarà suport per a l’anàlisi bioinformàtica de dades de cèl·lules individuals.
Publicacions
Experimental Hematology. 98, 1-13 (2021)
Science (80-. ).6500, (2021).
Cell 1–17 (2021)
Elife 10, 1–20 (2021).
Nature Biotechnology volume 38, pages747–755 (2020)
