Proteòmica
GINYS-IJC-006
Carolina De La Torre
Core Facility Leader
Unitat de Proteòmica
Edifici IJC, Campus ICO-Germans Trias i Pujol
Ctra de Can Ruti, Camí de les Escoles s/n
08916 Barcelona, Spain
La unitat de Proteòmica de l'Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras s'ha creat per donar suport a la comunitat científica que ofereix serveis d'espectrometria de masses al sector acadèmic i privat.
Un dels objectius principals de la unitat és oferir un servei d'alta qualitat en les disciplines següents: proteòmica descriptiva, proteòmica quantitativa (SILAC, TMT, Label Free), identificació de biomarcadors a través de les principals malalties humanes, caracterització de proteïnes i identificació de post-traduccions. modificacions (enriquiment de fosfo i fosfo, enriquiment d'acetil i acetil, ribosilació d'ADP), identificació i quantificació de les interaccions proteïna-proteïna i identificació i validació biològica addicional de pèptids bioactius amb aplicacions potencials en la cura de la salut humana, inclosos els suplements alimentaris i els cosmètics, entre altres.
La unitat de proteòmica, en un esforç per implementar la filosofia de l'Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras, treballa per impulsar la incorporació de la proteòmica com a eina necessària per al desenvolupament de projectes clínics i bàsics al nostre centre. En aquesta línia, la implantació de serveis d'última generació permet als investigadors clínics i bàsics aplicar aquestes eines a la medicina personalitzada.
Serveis
Anàlisis de proteòmica LC-MSMS
- Identificació de proteïnes a partir d’una sola banda
- Identificació de proteïnes i quantificació de mostres complexes – Anàlisi proteòmica basada en iTRAQ – Anàlisi de Proteòmica Basada en TMT – Anàlisi proteòmica basada en SILAC – Quantificació sense etiquetes – Monitorització de reaccions paral·leles (PRM) – SRM i MRM
- Anàlisi de modificació post-traduccional de proteïnes: – Anàlisi proteòmica basada en iTRAQ – Anàlisi de Proteòmica Basada en TMT – Anàlisi proteòmica basada en SILAC – Quantificació sense etiquetes – Monitorització de reaccions paral·leles (PRM) – SRM i MRM
- Xarxes d’interacció proteïna-proteïna: – Co-immunoprecipitació (co-IP) – Anàlisi de la interacció de proteïnes de reticulació – Assaig pull-down
- Anàlisi de modificació post-traduccional de proteïnes: – Fosforilació (fosfoenriquiment i identificació del lloc de fosforilació) – Acetilació (enriquiment d’anticossos acetil-lisina) – Metilació – ADP-ribosilació
Servei de Bioinformàtica per a proteòmica
- Anotació funcional i anàlisi d’enriquiment
- Anàlisi de clustering
- Anàlisi de xarxes
- Anàlisi estadística
- Anàlisi proteòmica de les modificacions post-traduccionals
Aplicacions de la proteòmica
Identificació i validació de biomarcadors en diferents tipus de mostres:
- Cèl·lules.
- Líquids (saliva, sèrum, plasma, orina, líquids intersticials, etc.)
- Teixits (múscul, cervell, pulmó, ronyó, cor, retina, etc.)
- Fecal
- Exosomes
- Secretoma
- Mat.risome
Personal
Carolina De La Torre | cdelatorre@carrerasresearch.org
| 935 572 800 (Mon-Fri 08.30-17.30) | ORCID
| Pàgina PRC
