Plataforma de descobriment de fàrmacs
A la plataforma de detecció de fàrmacs (DSP), oferim suport expert per a projectes de biologia química i descobriment de fàrmacs. La nostra plataforma accepta projectes de tota la comunitat investigadora de l'IRB Barcelona, així com de projectes externs, tant del món acadèmic com del sector. El nostre equip d'experts ofereix suport experimental a mida per a una àmplia gamma d'objectius i tecnologies durant la fase de descobriment de candidats, des de la detecció d'alt rendiment (HTS) fins a l'optimització de leads.
L'ús d'equips d'última generació (que es detallen a continuació) juntament amb un robust programari d'anàlisi, us permeten executar els vostres projectes seguint els estàndards industrials d'una manera precisa, ràpida i fiable.Serveis
Oferim suport complet al descobriment de fàrmacs adaptat a les necessitats dels investigadors, des del disseny experimental fins a la validació en laboratori humit, amb la possibilitat d’anàlisis quimioinformàtiques i bioinformàtiques. Avaluem la viabilitat teòrica pel que fa a la rellevància dels assajos, el nivell de rendiment i la viabilitat tècnica. Això és seguit pel desenvolupament d’assaigs, aconseguint estàndards industrials. La instrumentació disponible al DSP és compatible amb biblioteques de petites molècules, extractes biològics, pèptids, anticossos i altres molècules.
Els nostres serveis inclouen:
- Disseny experimental i viabilitat: Avaluació del projecte pel que fa a la rellevància dels assajos biològics, les tecnologies, la rendibilitat i les cascades de cribratge no només en termes d’eficàcia sinó també de DMPK (Metabolisme i Farmacocinètica de fàrmacs) i seguretat.
- Desenvolupament d’assaig: seguint els estàndards industrials, assegurem les millors condicions per als vostres assajos en presència i absència de compostos estàndard (cinètica, titulacions de components d’assaig, miniaturització d’assaig, pre-incubació de compostos, etc.) i efecte DMSO, reproductibilitat, senyal i reactiu. factors d’estabilitat i Z´, entre d’altres.
- HTS: cribratge del conjunt de compostos/extractes (des de conjunts petits fins a grans que comprenen 200.000 compostos o més). El procés implica una pantalla pilot (uns 2.000-5.000 compostos), un cribratge de la biblioteca (des de petits conjunts fins a més de 200.000 compostos) i la confirmació i validació d’èxit mitjançant assaigs ortogonals i de dosi-resposta. A més, podem realitzar agrupacions químiques.
- Sinèrgia: Avaluació de l’efecte de les interaccions entre els diferents components.
- Hit-to-Lead i Lead Optimization: Prova de diversos compostos en mode dosi-resposta (més de 64 compostos a 10 dosis, per duplicat, per dia) i caracterització del mecanisme d’acció (mecanisme d’enllaç, temps de residència, etc.) entre d’altres. .
Podem treballar amb assaigs bioquímics i cel·lulars en formats de 96 i 384 pous per estudiar una àmplia gamma d’objectius mitjançant l’avaluació de diferents resultats biològics
Els projectes executats al DSP poden utilitzar una àmplia gamma de tecnologies de lectura:
- Absorbància
- Fluorescència
- Polarització de fluorescència
- Lluminescència
- FRET Tecnologia alfa
- ELISA
- High Content Imaging Screening: plataforma de cribratge
- Col·laboració amb Advanced Digital Microscopy Facility
Equipament
A l’IRB Barcelona hem posat en marxa una plataforma de cribratge amb tecnologia d’última generació, que permet HTS i dóna suport als projectes Hit to Lead i Lead Optimization d’una manera eficient i automatitzada. Es poden executar diferents assajos/procés en paral·lel de manera integrada o autònoma.
Cal destacar que la plataforma està equipada amb el següent:
- Estació de treball Cell Explorer de Perkin Elmer: plataforma de braç robòtic amb programari actualitzat i gran capacitat d’emmagatzematge per processar plaques d’assaig de manera automatitzada, permetent la integració amb tots els robots utilitzats per la plataforma.
- Lector de plaques Envision de Perkin Elmer: compatible amb diverses tecnologies (Fluorescència, Ultraluminescència, Absorbància, FRET, Alfa i Polarització de Fluorescència).
- Echo 650 de Beckman Labcyte: dispensador acústic capaç d’afegir nanogotes de 2,5 nl, mesurar el contingut de DMSO i evitar la contaminació creuada (sistema sense puntes); compatible amb mostres viscoses com extractes naturals.
- Dispensador multigota de Thermo: dispensador a granel capaç d’afegir volums des de 1.000 μl fins a 1 μl.
- Zephyr de Perkin Elmer: pipeta de 96 pous Rentadora BIOTEK: rentaplats 96 i 384. Incubadora de plaques automatitzada per a experiments bioquímics o basats en cèl·lules amb control de temperatura, CO2 i humitat.
Compostos
- Biblioteca composta 50.000 compostos de la biblioteca ChemDiv, representatius de més d’1.500.000 compostos. A més, la biblioteca conté subconjunts centrats com ara la interacció proteïna-proteïna (PPI), el SNC, el càncer, el conjunt divers i el conjunt semblant al plom, entre d’altres.
- 2.400 compostos de la col·lecció de medicaments aprovada per la FDA de MCE. Creixement constant amb l’objectiu d’arribar a més de 100.000 compostos (inclosos els propietaris i nous) el 2024.
