Metabolòmica

GINYS-IGTP-004
José María Hernández Pérez
Responsable del servei

Instal·lació de Proteòmica i Metabolòmica
Edifici IGTP Mar, Planta Baixa
Crta. de Can Ruti – camí de les escoles, s/n
08916 Badalona, ​​Barcelona, ​​Spain

La instal·lació ofereix consultoria i serveis en camps d'estudi que requereixen tècniques de proteòmica o metabolòmica basades en espectrometria de masses. Configurem l'anàlisi de metabòlits mitjançant perfils diferencials o dirigits (molècules específiques) en qualsevol tipus de líquid o teixit biològic inclosa l'exhalació respiratòria. Perfeccionarem qualsevol prova nova en aquests dos camps requerida pels nostres clients. L'activitat de Proteòmica i Metabolòmica Core Facility es basa en col·laboracions amb investigadors per afinar la tècnica necessària, analitzar mostres i preparar els resultats. Ens centrem en l'àmbit biomèdic; identificació i validació de biomarcadors, mecanismes de malaltia mitjançant perfils d'expressió de proteïnes, modificacions post-traduccions i interaccions proteïna-proteïna.

Serveis

Serveis de Metabolòmica

Perfils de metabòlits de tot tipus (volàtils, semivolàtils i no volàtils, polars i no polars) generalment per al descobriment de biomarcadors
  • Anàlisi GC/MS (Thermo GC8060 MD800 EI+, CI-, CI+)
  • Mostra de nanoHPLC de perfil LC/MS ESI-QqTof MS (Agilent 1200 BrukerMicrOTOFQ) (Anàlisi de perfils)
  • Anàlisi uPLC ESI-QQQ (Agilent 1260 Agilent 6410BA)
Identificació i descripció dels metabòlits
  • Anàlisi GC/MS (Thermo GC8060 MD800 EI+)
  • Anàlisi LC/MS/MS mostra nanoHPLC ESI-QqTof MS
  • Quantificació absoluta i relativa de molècules petites
  • Anàlisi SIM GC/MS (Thermo GC8060 MD800 EI+, CI-, CI+)
  • Anàlisi FID de GC (Perkin Elmer)
  • Mostra de nanoHPLC de perfil LC/MS ESI-QqTof MS (Agilent 1200 BrukerMicrOTOFQ) (Anàlisi de perfils)
  • Anàlisi uPLC ESI-QQQ, MRM (Agilent 1260 Agilent 6410BA)

Dins d’aquesta secció, la nostra unitat ha desenvolupat procediments per:

  • àcids grassos de cadena curta mitjana i gran en sèrum i membranes cel·lulars
  • aminoàcids
  • àcids orgànics a l’orina
  • acilcarnitines al plasma
  • prostanoides al plasma
  • compostos volàtils de carboni a l’alè
  • hormones tiroïdals plasmàtiques lliures
  • hormones esteroides a la saliva
  • sucres a l’orina
  • mucopolisacàrids en sèrum i orina

Equipament

Espectròmetres
  • Espectròmetre de masses híbrid Q-TOF Micro ESI-QqTOF MS i Nano HPLC (Agilent sèrie 1200™)

Espectròmetre híbrid QqT acoblat a un nanocromotàgraf líquid per a la identificació de pèptids i proteïnes. També pot realitzar anàlisis de metabòlits en mode lineal. Resolució nominal de 20.000. S’utilitza en mode tàndem per identificar pèptids en mode únic per a la quantificació per a anàlisis de perfils.

  • Espectròmetre de masses triple quàdruple ESI-QQQ MS (Agilent™ 6410 BA) i quaternari uPLC (Agilent™ 1260 Infinity)

Espectròmetre acoblat a uPLC per a la quantificació de metabòlits en mode MRM (monitoratge de reaccions múltiples). També funciona en altres quatre modes de funcionament, SIM (monitorització d’ions únics), precursors d’ions, fragments d’ions, pèrdues neutres.

  • Cromatògraf de gasos acoblat a l’espectròmetre de masses

GC/EI + Ci + Ci  /MS (GC series™ amb MD800™ i AS2000™ Thermo Instruments).

Desorbidor tèrmic per a volàtils (MW-1A™ Rektorik)

Cromatògrag de gasos FID (ionització de flama)

  • MALDI TOF/TOF Autoflex Speed ​​TOF/TOF – Espectròmetre de masses MALDI amb resolució nominal per a 20.000 parapèptids
Cromatògrafs líquids analítics i preparatius
  • Bomba quatenària HPLC amb detector UV/vis i escalfador de columna (Sèrie Waters™ 600)
  • FPLC Äkta Purifier™ (GE Healthcare)
  • HPLC alliance™ 2695 (Waters) amb detectors 2996 UV/vis i desviació de l’índex de refracció 2414FPLC
  • HPLC alliance™ 2695 (Waters) amb detectors 2996 UV/vis i fluorescència 2475

Personal

Responsable
José María Hernández Pérez | jmhernandez@igtp.cat | 930 330 535

CENTRE

IGTP - Institut d'Investigació en Ciències de la Salut Germans Trias i Pujol

Edifici Mar
Ctra. de Can Ruti,
Camí de les escoles, s/n

08916 Badalona http://www.germanstrias.org/ca-index/

ÀMBITS RIS3CAT

  • Sistema educatiu i de generació de coneixement
  • Sistema industrial
  • Sistema sociosanitari

CATEGORIES

  • EQUIPAMENT TECNOLÒGIC
    • Metabolòmica

TARIFES I ACCÉS

Nivell de Disponibilitat: Baixa
Procediment d’accès:

Obert

CERCA - Ginys