Resposta Immune i Biomarcadors
GINYS-ISGLOBAL-004
Carrer Roselló 153 (CEK building, 1st floor)
E-08036 Barcelona, Catalonia, Spain
E-08036 Barcelona, Catalonia, Spain
Aquesta Plataforma ofereix com a servei la quantificació d’un ampli panell de biomarcadors mitjançant diferents tecnologies com ELISAs, x-MAP Luminex i OLINK (laboratori CORE certificat internacionalment), en diversos bio-espècimens. Els biomarcadors perfilats són principalment proteïnes, i inclouen anticossos de diferents isotips i subclasses enfront panells customitzats d’antígens, i altres marcadors immunologics com les citocines, quimiocines i els factors de creixement. També podem mesurar biomarcadors implicats en altres processos fisiològics com metabòlics, neurològics, cardiovasculars, etc.
Entre els aspectes més destacats de la Plataforma es troben: i) la capacitat de mesurar diversos analits multiplexats, obtenint informació multiparamètrica a partir de mostres úniques en Luminex i Olink, ii) la miniaturització, ideal per volums de mostra reduïts (ex. estudis amb mostres de cohorts pediàtriques), iii) la versatilitat i adaptabilitat a les necessitats (els kits poden ser comercials o es poden produir internament), iv) l’alt rendiment (equips semi-automatitzats de manipulació de líquids), v) la capacitat de mesurar la funcionalitat dels anticossos (ex. inhibició de la unió, assajos de neutralització) i vi) la complementarietat de tècniques (ex. Luminex enfront Olink per citocines i altres biomarcadors).
Els nostres panells utilitzen proteïnes recombinants comercials o produïdes internament en sistemes d’expressió procariota o eucariota, i anticossos monoclonals (mAbs), per aplicacions personalitzades. Addicionalment podem fenotipar cèl·lules del sistema immune mitjançant citometria de flux, i analitzar respostes antigen-específiques de limfòcits T mitjançant tinció intracel·lular de citocines (ICS) i assajos per mesurar marcadors de limfòcits T induïts per activació (AIM) mitjançant citometria de flux i ELIspot/FluoroSpot.
Entre els coneixements i capacitats específics que oferim com a valor afegit s’inclouen l’àmplia experiència del grup en immunologia i la seva llarga trajectòria en monitorització immune, el desenvolupament de programes específics per el control de qualitat (QA/QC) i el preprocessament de les dades, i la possibilitat de realitzar anàlisis estadístics, consultoria, formació i desenvolupament de capacitats, inclòs per personal de laboratori de països de baixa i mitja renta.
Serveis
– Assajos ELISA i colorimètrics utilitzant kits comercials o desenvolupats internament per mesurar concentració de diferents analits.
– Assajos multiplex de citocines mitjançant Luminex utilitzant kits comercials per mesurar concentració de proteïnes com citocines, quimiocines, factors de creixement i altres, i expressió gènica amb Invitrogen™ QuantiGene™ Plex.
– Assajos multiplex d’anticossos mitjançant Luminex desenvolupats pel nostre grup per mesurar nivells i avidesa de IgG, IgM, IgA IgA1, IgA2, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgE enfront panells flexibles d’antígens de diferents microbis.
– Assajos multiplex d’anticossos funcionals mitjançant Luminex.
– Assajos Olink utilitzant kits comercials per mesurar nivells de diferents biomarcadors (fins a 92) en format multiplex (T96, T48 i 21-Flex) (CoreLab Certificat Internacionalment: https://olink.com/products-services/sample-analysis-service/external-service-providers/)
– Altres assaigs cel·lulars (limfòcits T i B) segons requirements (citometria de flux, ELIspot/FluoroSpot)
Per a aquestes tecnologies oferim:
a) Assessorament sobre quins marcadors, tecnologies (ELISA, Luminex, Olink) i kits utilitzar segons l’objectiu i especificitats de l’estudi
b) Disseny d’experiments
c) Contactes proveïdors i preparació de pressupostos
d) Compra dels reactius i kits
e) Realització dels assajos
f) QA/QC dels resultats
g) Pre-processament de les dades
h) Preparació de l’informe de resultats. Opció d’anàlisi estadística de les dades.
i) Assessorament en la interpretació dels resultats
j) Addicionalment: Formació i capacity building en pre-processament i anàlisi de les dades, inclosa per al personal de laboratori de països d’ingressos mitjans i baixos.
k) Addicionalment: Expressió de proteïnes i anticossos monoclonals per proporcionar a clients o per realitzar assajos d’anticossos antigen-especifics (customitzat)
m) Addicionalment: Citometría de flux i ELIspot/FluoroSpot (adquisició/lectura de mostres amb instruments plataforma IDIBAPS)
Equipament
– Lector d’ELISA (EPOCH2, BioTek)
– Dos rentadors automàtics (BioTek)
– Instruments Luminex: un Magpix, un Luminex 100/200 i dos FlexMap3D
– Accessoris pels assajos Luminex:
- Kingfisher Flex 96 deepwell (Thermo Fisher) per l’acoblamet automatitzat d’antígens a les microsferes)
- Integra Assist Plus i Integra Viaflo 384 (Integra) per la manipulació de líquids en plaques de 384 pouets
- Dos agitadors orbitals de plaques de 96 pouets (Thermo Fisher)
- Dos agitadors orbitals de plaques de 384 pouets (Heidolph Titramax: https://www.milian.com/product/0O-43-20?language=en)
– Guava easyCyte per comptar automàticament cèl·lules i microesferes
– OLINK Signature 100
– Accessoris pels assajos OLINK:
- Signature Q100 Interface plate: 96.96, 48.48 and 24.192
- Centrífuga per plaques (Eppendorf (5430/5430R))
- Microcentrífuga per strips i tubs (IKA Mini G Centrifuge, Fisher Scientific)
- Vortex de plaques (MaxMate Eppendorf 230V Version)
- Bloc per plaques (MixMate PCR 96 tube holder, Eppendorf)
- Pipetes simples i multicanal de precisió (Rainin, Mettler Toledo)
- Bloc de fred (-20ºC) per treballar amb enzims
- Termociclador (SimpliAMP Thermal cycler, Applied Biosystems)
– Accés a la plataforma de citometría d’IDIBAPS (FACS FORTESSA 4 i 5 lasers, Aurore Cytek Cytometry)
– Programes per executar ELISA (GraphPad Prism), Luminex (X-ponent 4.3), Olink (NPX Signature software: https://olink.com/products-services/data-analysis-products/olink-npx-signature/), i citometria de flux (FlowJo).
Personal
Ruth Aguilar | ruth.aguilar@isglobal.org
| ORCID
Marta Vidal | marta.vidal@isglobal.org
| ORCID
Felipe Raimondi | felipe.raimondi@isglobal.org
Cèlia Torres | celia.torres@isglobal.org
Projectes
Títol:
ATHLETE - Advancing Tools for Human Early Lifecourse Exposome Research and Translation
Referència:
https://www.isglobal.org/ca/-/athlete
Organisme finançador:
EU-H2020
Estat:
Actiu
Títol:
BISC - Barcelona Life Study Cohort
Referència:
http://www.biscproject.org
Organisme finançador:
EIC-HEI
Estat:
Acabat
Títol:
COVICAT - Cohorte Covid-19 en Cataluña
Referència:
https://www.isglobal.org/ca/-/covicat
Organisme finançador:
CERCA, EIT-Health,”la Caixa” Social Research grant SR20-01024
Estat:
Actiu
Títol:
EPHOR - Exposome Project for Health and Occupational Research
Referència:
https://www.ephor-project.eu/
Organisme finançador:
EU-TNO (NED)
Estat:
Actiu
Títol:
EChiLiBRiST - Development and validation of a quantitative point-of-care test for the measurement of severity biomarkers to improve risk stratification of fever syndromes and enhance child survival
Organisme finançador:
EU-HE
Estat:
Actiu
Títol:
Baseline host and environmental factors that impact pre-erythrocytic malaria vaccine (hypo)responsiveness in endemic regions
Organisme finançador:
NIAID-NIH( USA) et al.
Estat:
Actiu
Títol:
END-VOC - Ending COVID-19 variants of concern through cohort studies
Referència:
HORIZON-HLTH-2021-CORONA-01-02
Organisme finançador:
EU-HE
Estat:
Actiu
Títol:
INCENTIVE - Indo-European Consortium for next generation influenza vaccine innovation
Organisme finançador:
EU-H2020
Estat:
Actiu
Títol:
Impact of coinfections on the balance of antibody and T helper responses to antigen targets of naturally-acquired and vaccine immunity to major human pathogens
Organisme finançador:
ISCIII
Estat:
Acabat
Títol:
Infection acquisition in early life and health outcomes in childhood
Referència:
https://www.isglobal.org/ca/-/subclinical-infections-in-children-and-long-term-health-effects
Organisme finançador:
Maratò TV3
Estat:
Acabat
Títol:
CoViproteHCt - Identifying protective immunity to SARS-CoV-2 in Health Care Personnel
Organisme finançador:
EIT Health
Estat:
Acabat
Títol:
ANTICOV-IMMUNO -The impact of COVID-19 treatment on the type, strength and duration of antibody and cellular immune responses in SARS-CoV-2 patients in sub-Saharan Africa
Organisme finançador:
UNITAID
Estat:
Acabat
Publicacions
Evaluation of the accuracy of a multi-infection screening test based on a multiplex immunoassay targeting imported diseases common in migrant populations.
Travel Med Infect Dis. 2023 Dec 21;57:102681.
Travel Med Infect Dis. 2023 Dec 21;57:102681.
Individual blood concentrations of persistent organic pollutants and chemical elements, and COVID-19: A prospective cohort study in Barcelona.
Enviromental Research 2023; 223
Enviromental Research 2023; 223
Long-Term Exposure to Air Pollution and COVID-19 Vaccine Antibody Response in a General Population Cohort (COVICAT Study, Catalonia).
Environ Health Perspectives. 2023; 131-4, pp.4700
Environ Health Perspectives. 2023; 131-4, pp.4700
RBD-Based ELISA and Luminex Predict Anti-SARS-CoV-2 Surrogate-Neutralizing Activity in Two Longitudinal Cohorts of German and Spanish Health Care Workers.
Microbiol Spectrum. 2023; 14-11(1), pp.e0316522.
Microbiol Spectrum. 2023; 14-11(1), pp.e0316522.
Evaluation of antibody serology to determine current helminth and Plasmodium falciparum infections in a co-endemic area in Southern Mozambique.
PLoS Neglected Tropical Diseases. 2023; 16-6, pp.e0010138.
PLoS Neglected Tropical Diseases. 2023; 16-6, pp.e0010138.
SARS-CoV-2 infection, vaccination, and antibody response trajectories in adults: a cohort study in Catalonia.
BMC Medicine. 2022; 20-1, pp.347.
BMC Medicine. 2022; 20-1, pp.347.
Antibody conversion rates to SARS-CoV-2 in saliva from children attending summer schools in Barcelona, Spain.
BMC Medicine. 2021; 19-1, pp.309.
BMC Medicine. 2021; 19-1, pp.309.
HIV infection and placental malaria reduce maternal transfer of multiple antimalarial antibodies in Mozambican women.
Journal of Infection. 2021; 82-4, pp.45-57.
Journal of Infection. 2021; 82-4, pp.45-57.
Highly Sensitive and Specific Multiplex Antibody Assays To Quantify Immunoglobulins M, A, and G against SARS-CoV-2 Antigens.
Journal of Clinical Microbiology. 2021; 59-2.
Journal of Clinical Microbiology. 2021; 59-2.
Seven-month kinetics of SARS-CoV-2 antibodies and role of pre-existing antibodies to human coronaviruses.
Nature Communications. 2021; 12-1, pp.4740.
Nature Communications. 2021; 12-1, pp.4740.
Antibody responses to the RTS,S/AS01E vaccine and Plasmodium falciparum antigens after a booster dose within the phase 3 trial in Mozambique.
NPJ Vaccines. 2020; 5, pp.46.
NPJ Vaccines. 2020; 5, pp.46.
A Balanced Proinflammatory and Regulatory Cytokine Signature in Young African Children Is Associated With Lower Risk of Clinical Malaria.
Clinical Infectious Diseases. 2019; 69-5, pp.820-828.
Clinical Infectious Diseases. 2019; 69-5, pp.820-828.