Genòmica
GINYS-CRG-005
El CRG Genomics Core Facility es va establir el 2008 i actualment admet tecnologies de seqüenciació de nova generació.
Des de la seva fundació, el CRG ha fet importants inversions en genòmica, inclosa la compra de diversos instruments de seqüenciació de nova generació. S'han implementat diverses tecnologies d'alt rendiment per avaluar l'expressió diferencial, la variació genètica interindividual, el descobriment de microRNA, la seqüenciació del genoma, la reseqüenciació dirigida, el perfil epigenètic i la identificació de llocs d'unió d'ADN o proteïnes associades a ARN.
Serveis
El camp de la seqüenciació ha experimentat un canvi important amb la introducció de tecnologies innovadores de seqüenciació d’alt rendiment. La Unitat de Genòmica del CRG està actualment equipada amb la tecnologia de seqüenciació Illumina.
El servei de seqüenciació s’ofereix al CRG, PRBB i usuaris externs. Realitzem ChIP-Seq, mRNA-Seq, seqüenciació de petites molècules d’ARN com ara miRNA, seqüenciació d’amplicons, re-seqüenciació del genoma i seqüenciació de novo.
A partir de mostres d’ADN o ARN que ens proporcionen, el servei inclou:
- Preparació de la biblioteca de seqüenciació incl. connexió d’adaptadors específics de plataforma
- Control de qualitat de la biblioteca
- Quantificació bibliogràfica
- Realització de la seqüenciació
- Dades de trucada base, control de qualitat de dades de seqüència, posada a disposició de les dades (fitxers de seqüències, fitxers de qualitat, fitxers d’alineació)
