Expressió de proteïnes

GINYS-IRB-003
Dr. Nick Berrow
CORE FACILITY MANAGER
La Protein Expression Core Facility es va fundar per oferir activitats de clonació i cribratge d'expressió d'alt rendiment (HTP) en les quals moltes variacions d'una proteïna (p. es pot realitzar en paral·lel. Alternativament, les activitats HTP es poden dirigir al genoma d'un organisme particular (o família d'organismes) per clonar i cridar l'expressió moltes proteïnes diferents d'un sol organisme. A més, la instal·lació compta amb l'experiència i l'equip necessari per produir i purificar quantitats de mil·ligrams de proteïna d'hostes d'expressió procariotes i eucariotes, actualment E. coli, Sf9 (insecte) i HEK293T o HEK293A (cèl·lules de mamífers). Molts dels protocols estan automatitzats, amb la instal·lació fent un ús complet de la robòtica de manipulació de líquids per a la manipulació de plaques HTP per al cribratge d'expressió a petita escala (μg) i sistemes de purificació automatitzats (Äkta Xpress) per a la purificació de proteïnes a escala més gran (mg). La instal·lació també ofereix molts reactius d'alta qualitat per a la clonació i l'expressió de proteïnes, com ara soques d'E.coli resistents als bacteriòfags competents, medis d'expressió especialitzats i enzims recombinants. Si cal, la instal·lació també pot oferir serveis personalitzats de clonació i modificació de vectors.

Serveis

  • Clonació HTP personalitzada per generar vectors d’expressió
    La tècnica de clonació independent de l’enzim de restricció i lligament In-Fusion™ permet la producció precisa de construccions definides per l’usuari, inclosa la producció de construccions mutants, quimèriques i bicistròniques (només E. coli). Hi ha molts pOPIN1 o pPEU In-Fusion™ – vectors preparats disponibles – feu clic aquí per descarregar la llista més recent o poseu-vos en contacte amb nosaltres. La majoria d’aquests vectors permeten l’expressió en E.coli (promotors basats en T7), cèl·lules de mamífers (potenciador precoç immediat de CMV fusionat amb el promotor de ß-actina de pollastre) o cèl·lules d’insectes (promotor p10 i recombinació intracel·lular dels ORF 603 i 1629). amb genoma baculoviral). En general, s’espera que l’investigador proporcioni la “plantilla” per a les operacions de clonació, però la instal·lació també pot obtenir plasmidis o ADNc.
  • Cribratge d’expressió en E. coli
    Es pot examinar una placa de microtitulació de 96 clons d’expressió (instal·lacions o derivats de l’usuari) a E. coli en aproximadament una setmana. Actualment, la pantalla consisteix en l’ús de dues soques d’expressió, amb l’expressió en cada soca que s’està provant mitjançant mètodes IPTG i d’autoinducció. Es poden incorporar soques d’E. coli addicionals (DE3) al procés de cribratge si cal.
  • Minipreparació del plasmidi HTP: 96 minipreparacions de pellets d’E. coli en format MTP en menys de dues hores
  • Expressió de proteïnes personalitzades i purificació de proteïnes intracel·lulars o secretades a escala de mil·ligrams
    Un mínim de dos passos de purificació generalment ens proporcionen pureses de proteïnes superiors al 95% per a la majoria de proteïnes. Els hostes disponibles actualment per a cultius d’expressió a gran escala són cèl·lules E. coli i HEK293T i actualment estem introduint cultius de cèl·lules d’insectes a gran escala a la nostra llista de serveis. El sistema de cèl·lules HEK293T s’ha utilitzat per produir amb èxit quantitats de mil·ligrams de proteïnes glicosilades secretades.
  • Producció de proteïnes marcades amb seleno-metionina en soques d’E.coli auxotròfiques o prototròfiques per a la determinació de l’estructura cristal·logràfica
    La nostra compra a granel de seleno-metionina produeix preus molt competitius per a les nostres proteïnes marcades d’E.coli.
  • Producció de proteïnes marcades amb 15N, 13C o deuteri en soques d’E.coli auxòtròfiques o prototròfiques per a RMN
  • Cribratge d’expressió en cèl·lules de mamífers (p. ex. HEK293T).
    Una placa de microtitulació de 96 clons d’expressió (derivats de la instal·lació o de l’usuari) es poden examinar a les cèl·lules en 1-2 setmanes.
  • Producció de baculovirus recombinants mitjançant les suites vectorials pOPIN o pPEU o a partir de construccions existents (per exemple, pFastBac). La recombinació a la cèl·lula (Sf9) dels vectors pOPIN i pPEU amb el genoma baculoviral és ràpida i sense fons.
  • Les proteases recombinants 3C (PreScission), TEV i SUMO etiquetades amb his estan disponibles per a l’eliminació dels “partners” de fusió de les proteïnes expressades.

També esperem que les glicosidases recombinants PNGasa i EndoF1 estiguin disponibles per a l’eliminació de fragments de sucre de proteïnes recombinants glicosilades abans de la cristal·lització. La instal·lació també obté molts reactius d’alta qualitat, que van des de soques de cèl·lules especialitzades competents en E. coli i reactius per a l’expressió de proteïnes fins a reactius d’etiquetatge i clonació per a l’ús d’investigadors individuals. La compra de reactius a través de les instal·lacions és generalment molt rendible.

Personal

CORE FACILITY MANAGER
Dr. Nick Berrow | nick.berrow@irbbarcelona.org | 934 020 264 | ORCID | Pàgina PRC

Projectes

Títol: P4EU: Producció i purificació de proteïnes
Referència: https://p4eu.org/
Organisme finançador: EU
Estat: Actiu

Publicacions

Quality control of protein reagents for the improvement of research data reproducibility
de Marco A, Berrow N, Lebendiker M, Garcia-Alai M, Knauer SH, Lopez-Mendez B, Matagne A, Parret A, Remans K, Uebel S, Raynal B
Nature Communications
On the origin of the selectivity of plasmidic H-NS towards horizontally acquired DNA: Linking H-NS oligomerization and cooperative DNA binding
Fernández-De-Alba C; Berrow NS; Garcia-Castellanos R; García J; Pons M
Journal Of Molecular Biology

CENTRE

IRB Barcelona - Institut de Recerca Biomèdica

Parc Científic de Barcelona
Baldiri Reixac, 10

08028 Barcelona http://www.irbbarcelona.org/ca

ÀMBITS RIS3CAT

  • Sistema educatiu i de generació de coneixement
  • Sistema industrial
  • Sistema sociosanitari

CATEGORIES

  • EQUIPAMENT TECNOLÒGIC
    • Proteòmica

TARIFES I ACCÉS

Nivell de Disponibilitat: Baixa
Procediment d’accès:

Obert

FACILITIES NETWORKS

PRB3-PROTEORED – Plataforma de Recursos Biomoleculars: Plataforma Proteómica PROTEORED
Contribuir al disseny i desenvolupament de projectes en l'àmbit de la biotecnologia i la biomedicina, establir nous conceptes en biologia, identificar noves dianes diagnòstiques i terapèutiques, promoure el desenvolupament de nous productes biofarmacèutics i disseccionar el mecanisme d'acció. de drogues i els seus efectes selectius en individus concrets.
Reach: Spain
Estat: Activa
Finançament: ISCIII
CERCA - Ginys