Single Cell (Célula única)

Equipos

10x Genomics Chromium™ System

La unidad está equipada con un instrumento Chromium Controller. Esta tecnología se basa en la microfluídica y permite la generación en paralelo de particiones unicelulares o núcleos con códigos de barras identificadores y la preparación de bibliotecas de secuenciación.

– Expresión génica del transcriptoma 3′ unicelular
– Cromo Single Cell ATAC (ensayo para la cromatina accesible a la transposasa)
– Multioma monocelular de cromo ATAC + Expresión génica

Transcriptómica espacial – Visium 

10x Genomics ha desarrollado un flujo de trabajo para secuenciar el ARNm sin la pérdida de información espacial. La solución de expresión génica espacial de Visium permite un transcriptoma completo y un análisis dirigido del ARNm mediante la secuenciación de alto rendimiento y, posteriormente, mapea el patrón de expresión de una transcripción en secciones de tejido mediante imágenes de microscopio de alta resolución.

Plataforma Tapestri (Mission Bio)

La plataforma Tapestri está diseñada para una secuenciación unicelular dirigida. La plataforma está diseñada para producir bibliotecas de secuenciación de ADNc dirigidas solas o en una solución multiómica que combina análisis de ADN y proteínas unicelulares dirigidas. Mission Bio ofrece la posibilidad de utilizar paneles de ADN y proteínas prediseñados o personalizados.

-Secuenciación de ADN dirigida a una sola célula Tapestri

-Secuenciación de ADN + Proteína dirigida unicelular Tapestri

Análisis de datos

La genómica unicelular y espacial permite la caracterización integral de las células en su identidad y función. Sin embargo, los datos de una sola célula son ruidosos y presentan varios retos computacionales y analíticos, que requieren la aplicación de herramientas diseñadas específicamente para su análisis. La unidad apoyará el análisis bioinformático de datos de células individuales.