Proteómica
GINYS-CRG-004
Carrer Doctor Aiguader 88
08003 Barcelona
La Unidad de Proteómica es un esfuerzo conjunto de la Universidad Pompeu Fabra y el Centro de Regulación Genómica por crear una infraestructura de investigación innovadora con un alto nivel de excelencia y sostenibilidad para apoyar a los científicos del ámbito biomédico. Como parte de la Infraestructura Nacional de Ciencias Ómicas ICTS-OmicsTech (www.omicstech.es), la Unidad de Proteómica es una unidad de referencia nacional en análisis de proteómica.
Las actividades de la Unidad se centran en la prestación de servicios de proteómica de alta calidad con un fuerte valor añadido a la comunidad investigadora mediante:
- Asesoramiento, experiencia y experiencia en análisis de proteómica
- Desarrollo de nuevos métodos y técnicas facilitadoras para la investigación e innovación puntera
- Formación y difusión activa de los nuevos métodos y avances científicos en el campo de la proteómica
Servicios
Caracterización de interacciones del proteoma
- Identificación de las interacciones proteína-proteína
- Identificación de las interacciones proteína-ADN
- Identificación de las interacciones proteína-ARN
Caracterización de modificaciones post-traduccionales
- Identificación y cuantificación de acetilaciones, metilaciones, y ubiquinaciones en proteínas purificadas
- Identificación y cuantificación de modificaciones post-traduccionales en histonas purificadas
- Identificación y cuantificación de fosfopéptidos
Caracterización de proteomas completos
- Cuantificación de proteomas (con y sin etiqueta – TMT, SILAC, etc)
- Cuantificación de fosfoproteomas (con y sin etiqueta – TMT, SILAC, etc)
- Caracterización de proteomas en biopsias líquidas (plasma, líquido encefalorraquídico)
Análisis de una sola proteína
- Confirmación de una proteína sobreexpresada en muestras complejas
- Identificación de una proteína en bandas de gel
- Determinación del peso molecular de proteínas intactas
Proteómica dirigida
- Selección de péptidos para la cuantificación de biomarcadores mediante proteómica dirigida
- Optimización de métodos para la cuantificación de biomarcadores mediante proteómica dirigida
- Cuantificación de biomarcadores mediante proteómica dirigida
Modificaciones de ARN y ADN
- Análisis de (ribo-)nucleósidos modificados por espectrometría de masas
Equipos
Como centro de proteómica de referencia, la Unidad de Proteómica dispone de equipos de última generación que incluyen sistemas de cromatografía líquida de alto rendimiento y espectrómetros de masas de alta resolución de tipo Orbitrap para identificar y cuantificar las proteínas de interés.
Los instrumentos disponibles en la Unidad de Proteómica cubren las técnicas más avanzadas del campo de la proteómica, siendo accesibles para los científicos nacionales e internacionales.
Personal
Proyectos
Título:
EU-LIFE: Alianza de institutos de investigación que abogan por una investigación excelente en Europa
Referencia:
https://eu-life.eu/
Organismo financiador:
EU
Estado:
Activo
Título:
EPIC-XS: Proteomics (2019-2022)
Referencia:
https://epic-xs.eu/
Organismo financiador:
EU
Estado:
Activo
Publicaciones
BRCA1 mutations in high-grade serous ovarian cancer are associated with proteomic changes in DNA repair, splicing, transcription regulation and signaling
Scientific Reports. 12 (1): 4445- - 2022-03-15 12(1)
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Urinary metabolic biomarkers of diet quality in European children are associated with metabolic health
Elife. 11 (e71332): - 2022-01-25 11(e71332),
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Molecular characterization of triple negative breast cancer formaldehyde-fixed paraffin-embedded samples by data-independent acquisition proteomics
Proteomics. 22 (3): - 2022-01-01 22(3),
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Multi-laboratory experiment PME11 for the standardization of phosphoproteome analysis
Journal Of Proteomics. 251 - 2022-01-01 251(),
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High-performance nano-flow liquid chromatography column combined with high- and low-collision energy data-independent acquisition enables targeted and discovery identification of modified ribonucleotides by mass spectrometry
Journal Of Chromatography a. 1665 - 2022-01-01 1665(),
Journal Of Chromatography a. 1665 - 2022-01-01 1665(),
