Plataforma de interacciones moleculares

GINYS-IDIBELL-006
Silvia Barceló
Cap de Plataforma
La Plataforma de Interacciones Moleculares proporciona apoyo científico-tecnológico a la comunidad científica en el campo de las interacciones moleculares y biomarcadores utilizando varios enfoques. En primer lugar, Surface Plasmon Resonance (SPR) permite la monitorización en tiempo real de cualquier tipo de interacciones moleculares (proteína-proteína, proteína-fármacos, proteína-vesículas, proteína-ARN,…) y realiza mediciones de alta precisión de las constantes de afinidad y cinéticas, la especificidad de unión, isotipado y cribado de posibles medicamentos / fármacos. A continuación, la tecnología Luminex permite la detección de hasta cincuenta biomarcadores diferentes a la vez en muestras biológicas y fluidos utilizando la tecnología de perlas magnéticas. Además, el metabolismo y la bioenergética, que controlan funciones celulares como la señalización celular, la proliferación o el destino celular, pueden ser medidos mediante el Seahorse en tiempo real en células vivas. La respiración mitocondrial, la glucólisis, la tasa de oxidación de ATP y la oxidación de ácidos grasos se pueden medir con alta precisión. 
Recientemente hemos adquirido una plataforma de transcriptómica y proteómica espacial de alta resolución, CosMx (Nanostring). CosMx SMI permite la rápida cuantificación y visualización de hasta 6.000 ARN y 64 analitos proteicos validados a resolución unicelular en biopsias y muestras de tejidos. 
Nuestra misión es ofrecer un soporte integrado, desde el diseño experimental, la optimización de las condiciones del ensayo, la ejecución de experimentos hasta el análisis de datos y la generación de informes. Nuestra tecnología punta junto con la gran experiencia y conocimiento en investigación biomédica y ciencia de proteínas están al servicio de investigadores internos y externos

Servicios

  • Transcriptómica y proteómica espacial a resolución de célula única mediante la plataforma CosMx (Nanostring). Paneles de 6000-ARN, 1000- ARN o 64-proteinas en formato de 2- o 4- portas. 
  • Determinación de la constante de afinidad (KD), cinética: constantes de asociación y disociación (kon, koff) en diferentes modelos. Determinación de la concentración efectiva y control de calidad. Isotipado de anticuerpos. Cribado de posibles fármacos / biosimilares
  • Cuantificación ultrasensible de hasta 4 biomarcadores immunológicos y neuronales en fluidos biológicos en placas de 96 (SIMOA, Quanterix)
  • Cuantificación de hasta 50 biomarcadores en muestras y fluidos biológicos en placa de 96 pocillos por Luminex
  • Medida de la tasa de consumo de oxígeno (OCR) y la tasa de acidificación extracelular (ECAR) en placa de 96 pocillos (Seahorse): respiración mitocondrial, glucólisis, producción de ATP, lipólisis
  • Escaneo fluorescente de varios formatos
  • Diseño experimental, configuración y optimización de condiciones experimentales
  • Apoyo científico-tecnológico a investigadores
  • Capacitación de nuevos usuarios en el uso del equipo.

Equipos

  • CosMx Spatial Multiomics Single-Cell Imaging Platform (Nanostring)
  • SIMOA SR-X Ultra-sensitive biomarker detection (Quanterix)
  • Biacore T-200 (GE) para análisis SPR de interacciones
  • Analizador Seahorse XFe96 (Agilent) para la detección de OCR y ECAR en una placa de 96 pocillos
  • Magpix (Luminex) que incluye software xPonent 4.2 para análisis multiplex de hasta 50 perlas magnéticas
  • Escáner de fluorescencia Typhoon FLA9500 (GE) equipado con láser azul, verde y rojo
  • Software ImageQuant TL 7.0

Personal

Publicaciones

SIRT6-dependent cysteine monoubiquitination in the PRE-SET domain of Suv39h1 regulates the NF-kB pathway.
Santos-Barriopedro, I., Bosch-Presegué, L., Marazuela-Duque, A., de la Torre, C., Colomer, C., Vazquez, B.N., Fuhrmann, T., Martínez-Pastor, B., Lu, W., Braun, T., Bober, E., Jenuwein, T., Serrano, L., Esteller, M., Cheng, Z., Barceló-Batllori, S., Mostoslavsky, R., Espinosa, Ll., & Vaquero, A.
Nature communications, 2018, 9:101
KAT6B is a tumor suppressor histone H3 lysine 23 acetyltransferase undergoing genomic loss in small cell lung cancer.
Simó-Riudalbas, L., Pérez-Salvia, M., Setien F., Villanueva, A., Moutinho, C., Martínez-Cardús, A., Moran, S., Berdasco, M., Gomez, A., Vidal, E., Soler, M., Heyn, H., Vaquero, A., de la Torre, C., Barceló-Batllori S, … et Esteller, M
Cancer Research 2015, 75, 3936-3945
Integration of DIGE and bioinformatics analyses reveals a role of the anti-obesity agent tungstate in redox and energy homeostasis pathways in brown adipose tissue.
Barceló-Batllori, S., Esteban, Y. Moreno, S., Kalko, S. and Gomis, R.
Molecular and Cellular Proteomics, 2008, 7, 378-393

CENTRO

IDIBELL - Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge

Gran Via de l'Hospitalet, 199
2a planta Edifici Terapèutic

08908 Hospitalet de Llobregat http://www.idibell.cat/

ÁMBITOS RIS3CAT

  • Sistema educativo y de generación de conocimiento
  • Sistema industrial
  • Sistema sociosanitario

CATEGORÍAS

  • EQUIPAMIENTO TECNOLÓGICO
    • Metabolómica
    • Otros laboratorios especializados

TARIFAS Y ACCESO

Nivel de disponibilidad: Media
Procedimiento de Acceso:
Abierto
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