Plataforma de genómica y transcriptómica
GINYS-IRSP-005
La plataforma de Genómica y Transcriptómica es un laboratorio de apoyo enfocado en dar consejo, ofrecer servicios específicos en técnicas genómicas otranscritómicas y en poner a disposición equipamiento específico para los investigadores y la comunidad científica.
Servicios
La Plataforma de GT ofrece los siguientes servicios:
- Cuantificación y control de calidad de muestras de ácidos nucleícos (Qubit 3.0, Nanodrop 2000 y Bioanalyzer 2100)
- Procesamiento de muestras para estudios con Microarrays (Expresión génica, perfiles de miRNA, Citogenética, GWAS)
- Real-time PCR (Expresión génica, detección miRNA, discriminación alélica , Variación en número de copias (CNV), cuantificación absoluta….)
- Next-Generation Sequencing: secuenciación de exomas, secuenciación de ARNs o ADNs diana ( tecnología Ampli-Seq), secuenciación de ARNs pequeños, secuenciación de novo, ChiP-Seq, secuenciación de gen 16S, metagenómica…
- Secuenciación Sanger: secuenciación de ADN, análisis de mutaciones y polimorfismos, estudios de metilación del ADN, identificación de microorganismos, …
- Análisis de fragmentos: autetificación de líneas celulares, estudio de variación de número de copias (MLPA), pérdida de heterozigosidad (LOH), estudios de genótipado, inestabilidad de microsatélites, estudios de expansión de ADN repetitivo…
- Análisis de datos ómicos
Algunos de los equipos usados para llevar a cabo estas técnicas son accesibles, en formato autoservicio, para los investigadores tras realizar una formación específica.
Equipos
Equipos específicos
- Affymetrix GS 3000 System array platform (upgrade 7G).
- 7900HT Fast Real-Time PCR system (96-well, 384-well, and TLDA blocs) (AB-ThermoFisher Sci)
- Bioanalyzer 2100 (Agilent Tech).
- Nanodrop 2000 (ThermoFisher Sci).
- Qubit 3.0 (ThermoFisher Sci)
- Infinite M200 PRO (Tecan) lector de microplacas: espectrofotómetro, fluorímetro, luminómetro.
- 3130xl Genetic Analyzer capillary electrophoresis sequencer (ThermoFisher Sci).
- Ion GeneStudio S5 Next-Generation Sequencing System, with Ion Chef System (ThermoFisher Sci).
Personal
