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Respuesta inmune y biomarcadores

GINYS-ISGLOBAL-004
Carlota Dobaño
Head of Facility
carlota.dobano@isglobal.org | ORCID | Página PRC
Carrer Roselló 153 (CEK building, 1st floor)
E-08036 Barcelona, Catalonia, Spain
Esta Plataforma ofrece como servicio la cuantificación de un amplio panel de biomarcadores mediante diferentes tecnologías como ELISAs, x-MAP Luminex y OLINK (laboratorio CORE certificado internacionalmente), en diversos bio-especímenes. Los biomarcadores perfilados son principalmente proteínas, e incluyen anticuerpos de diferentes isotipos y subclases frente a paneles customizados de antígenos y otros marcadores inmunológicos como las citocinas, quimiocinas y factores de crecimiento. También podemos medir biomarcadores relacionados con otros procesos fisiológicos como metabólicos, neurológicos, cardiovasculares, etc.   

Entre los aspectos más destacados de la Plataforma se encuentran: i) la capacidad de medir varios analitos multiplexados, obteniendo información multiparamétrica a partir de muestras únicas en Luminex y Olink, ii) la miniaturización, ideal para volúmenes de muestra pequeños (ej. estudios con muestras de cohortes pediátricas), iii) la versatilidad y adaptabilidad a las necesidades (los kits pueden ser comerciales o producidos internamente), iv) el alto rendimiento (equipo semiautomatizado de manipulación de líquidos), v) la capacidad de medir la funcionalidad de los anticuerpos (ej. inhibición de la unión, ensayos de neutralización) y vi) la complementariedad de técnicas (ej. Luminex frente a Olink para citocinas y otros biomarcadores).  

En nuestros paneles usamos proteínas recombinantes comerciales o producidas internamente en sistemas de expresión procariota o eucariota, y anticuerpos monoclonales (mAbs), para aplicaciones personalizadas. Adicionalmente podemos analizar el fenotipo de células del sistema inmune mediante citometría de flujo, y las respuestas antígeno-específicas de linfocitos T mediante tinción intracelular de citocinas (ICS) y mediante ensayos para medir marcadores de linfocitos T inducidos por activación (AIM) mediante citometría de flujo y ensayos de ELIspot/FluoroSpot. 

Entre los conocimientos y capacidades específicos que se ofrecen como valores añadidos se incluyen la amplia experiencia del grupo  y su la larga trayectoria en monitorización inmune, el desarrollo de programas específicos de control de calidad (QA/QC) y preprocesamiento de los datos, y la posibilidad de realizar análisis estadísticos, consultoría, formación y desarrollo de capacidades, incluido para el personal de laboratorio de países de renta media y baja.

Servicios

–  Ensayos ELISA y colorimétricos utilizando kits comerciales o desarrollados internamente para medir concentración de diferentes analitos.
–  Ensayos multiplex de citocinas mediante Luminex utilizando kits comerciales para medir concentración de proteínas como citocinas, quimiocinas, factores de crecimiento u otras, y expresión génica mediante Invitrogen™ QuantiGene™ Plex.
–  Ensayos multiplex de anticuerpos mediante Luminex desarrollados por nuestro grupo para medir niveles y avidez de IgG, IgM, IgA IgA1, IgA2, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgE frente paneles flexibles de antígenos de diferentes microbios.
– Ensayos multiplex de anticuerpos funcionales mediante Luminex.
–  Ensayos Olink utilizando kits comerciales para medir niveles de hasta 92 biomarcadores en formato multiplex (T96, T48 y 21-Flex) (CoreLab Certificado Internacionalmente: https://olink.com/products-services/sample-analysis-service/external-service-providers/)
– Otros ensayos celulares (linfocitos T y B) según requerimiento (citometría de flujo, ELIspot/FluoroSpot)
 
Para estas tecnologías ofrecemos:
 
a)  Asesoramiento sobre qué marcadores, tecnologías (ELISA, Luminex, Olink) y kits utilizar según el objetivo y especificidades del estudio
b)  Diseño de experimentos
c)  Contactos proveedores y preparación de presupuestos
d)  Compra de los reactivos y kits
e)  Realización de los ensayos
f)   QA/QC de los datos generados
g)  Pre-procesamiento de los datos
h)  Preparación del informe de resultados. Opción de análisis estadístico de los datos.
i)   Asesoramiento en la interpretación de los resultados
j)  Adicionalmente: Formación y capacity building en preprocesamiento y análisis de los datos, incluido para el personal de laboratorio de países de ingresos medios y bajos.
k)  Adicionalmente: Expresión de proteínas y anticuerpos monoclonales para proporcionar a clientes o para realizar ensayos de anticuerpos antígeno-específicos (customizado)
m)  Adicionalmente: Citometría de flujo y ELIspot/FluoroSpot (adquisición/lectura de muestras usando instrumentos de la plataforma IDIBAPS)

Equipos

– Lector de ELISAs (EPOCH2, BioTek)
– Dos lavadores automaticos (BioTek) 
– Instrumentos Luminex: un Magpix, un Luminex 100/2002 y dos FlexMap3D  
– Accesorios para los ensayos Luminex:
  • Kingfisher Flex 96 deepwell (Thermo Fisher) para el acoplamiento automatizado de antígenos a las microesferas
  • Integra Assist Plus e Integra Viaflo 384 (Integra) para la manipulación de líquidos en placas de 384 pocillos
  • Dos agitadores orbitales de placas de 96 pocillos (Thermo Fisher) 
  • Dos agitadores orbitales de placas de 384 pocillos (Heidolph Titramax: https://www.milian.com/product/0O-43-20?language=en) 
– Guava easyCyte para contaje automático de células y microesferas
– OLINK Signature 100  
– Accesorios para los ensayos OLINK:
  • Signature Q100 Interface plate: 96.96, 48.48 and 24.192
  • Centrifuga para placas (Eppendorf (5430/5430R))
  • Microcentrifuga para strips y tubos (IKA Mini G Centrifuge, Fisher Scientific)
  • Vortex de placas (MaxMate Eppendorf 230V Version)
  • Bloque para placas (MixMate PCR 96 tube holder, Eppendorf)
  • Pipetas simples y multicanal de precisión (Rainin, Mettler Toledo)
  • Bloc de frio (-20ºC) para trabajar con enzimas
  • Termociclador (SimpliAMP Thermal cycler, Applied Biosystems)  
– Acceso a la plataforma de citometría de IDIBAPS (FACS FORTESSA 4 y 5 lasers, Aurore Cytek Cytometry)
– Softwares para ejecutar ELISA (GraphPad Prism), Luminex (X-ponent 4.3), Olink (NPX Signature software: https://olink.com/products-services/data-analysis-products/olink-npx-signature/), y citometría de flujo (FlowJo)

Personal

Head of Facility
Carlota Dobaño | carlota.dobano@isglobal.org | ORCID | Página PRC
Co-Head of Facility
Gemma Moncunill | gemma.moncunill@isglobal.org | ORCID | Página PRC
Contact Person
Ruth Aguilar | ruth.aguilar@isglobal.org | ORCID
Technician
Marta Vidal | marta.vidal@isglobal.org | ORCID
Felipe Raimondi | felipe.raimondi@isglobal.org
Cèlia Torres | celia.torres@isglobal.org

Proyectos

Título: ATHLETE - Advancing Tools for Human Early Lifecourse Exposome Research and Translation
Referencia: https://www.isglobal.org/ca/-/athlete
Organismo financiador: EU-H2020
Estado: Activo
Título: BISC - Barcelona Life Study Cohort
Referencia: http://www.biscproject.org
Organismo financiador: EIC-HEI
Estado: Acabado
Título: COVICAT - Cohorte Covid-19 en Cataluña
Referencia: https://www.isglobal.org/ca/-/covicat
Organismo financiador: CERCA, EIT-Health,”la Caixa” Social Research grant SR20-01024
Estado: Activo
Título: EPHOR - Exposome Project for Health and Occupational Research
Referencia: https://www.ephor-project.eu/
Organismo financiador: EU-TNO (NED)
Estado: Activo
Título: EChiLiBRiST - Development and validation of a quantitative point-of-care test for the measurement of severity biomarkers to improve risk stratification of fever syndromes and enhance child survival
Referencia: https://www.isglobal.org/ca/-/echilibrist-project
Organismo financiador: EU-HE
Estado: Activo
Título: Baseline host and environmental factors that impact pre-erythrocytic malaria vaccine (hypo)responsiveness in endemic regions
Organismo financiador: NIAID-NIH( USA) et al.
Estado: Activo
Título: END-VOC - Ending COVID-19 variants of concern through cohort studies
Referencia: HORIZON-HLTH-2021-CORONA-01-02
Organismo financiador: EU-HE
Estado: Activo
Título: INCENTIVE - Indo-European Consortium for next generation influenza vaccine innovation
Organismo financiador: EU-H2020
Estado: Activo
Título: Impact of coinfections on the balance of antibody and T helper responses to antigen targets of naturally-acquired and vaccine immunity to major human pathogens
Organismo financiador: ISCIII
Estado: Acabado
Título: Infection acquisition in early life and health outcomes in childhood
Referencia: https://www.isglobal.org/ca/-/subclinical-infections-in-children-and-long-term-health-effects
Organismo financiador: Maratò TV3
Estado: Acabado
Título: CoViproteHCt - Identifying protective immunity to SARS-CoV-2 in Health Care Personnel
Organismo financiador: EIT Health
Estado: Acabado
Título: ANTICOV-IMMUNO -The impact of COVID-19 treatment on the type, strength and duration of antibody and cellular immune responses in SARS-CoV-2 patients in sub-Saharan Africa
Organismo financiador: UNITAID
Estado: Acabado

Publicaciones

Evaluation of the accuracy of a multi-infection screening test based on a multiplex immunoassay targeting imported diseases common in migrant populations.
R Aguilar, A Cruz, A Jiménez, et al., A Requena-Méndez.
Travel Med Infect Dis. 2023 Dec 21;57:102681.
DOI: 10.1016/j.tmaid.2023.102681
Individual blood concentrations of persistent organic pollutants and chemical elements, and COVID-19: A prospective cohort study in Barcelona.
M Porta; J Pumarega; M Gasul; et al; G Moncunill; R Aguilar.
Enviromental Research 2023; 223
DOI: 10.1016/j.envres.2023.115419
Long-Term Exposure to Air Pollution and COVID-19 Vaccine Antibody Response in a General Population Cohort (COVICAT Study, Catalonia).
M Kogevina; M Karachaliou; A Espinosa; et al; C Dobaño.
Environ Health Perspectives. 2023; 131-4, pp.4700
DOI: 10.1289/EHP11989
RBD-Based ELISA and Luminex Predict Anti-SARS-CoV-2 Surrogate-Neutralizing Activity in Two Longitudinal Cohorts of German and Spanish Health Care Workers.
R Aguilar; X Li; CS Crowell; et al; M Gerhard.
Microbiol Spectrum. 2023; 14-11(1), pp.e0316522.
DOI: 10.1128/spectrum.03165-22
Evaluation of antibody serology to determine current helminth and Plasmodium falciparum infections in a co-endemic area in Southern Mozambique.
R Santano; R Rubio; B Grau-Pujol; G Moncunill.
PLoS Neglected Tropical Diseases. 2023; 16-6, pp.e0010138.
DOI: 10.1371/journal.pntd.0010138
SARS-CoV-2 infection, vaccination, and antibody response trajectories in adults: a cohort study in Catalonia.
M Karachaliou; G Moncunill; A Espinosa; C Dobaño.
BMC Medicine. 2022; 20-1, pp.347.
DOI: 10.1186/s12916-022-02547-2
Antibody conversion rates to SARS-CoV-2 in saliva from children attending summer schools in Barcelona, Spain.
C Dobaño; S Alonso; M Fernández de Sevilla; I Jordan.
BMC Medicine. 2021; 19-1, pp.309.
DOI: 10.1186/s12916-021-02184-1
HIV infection and placental malaria reduce maternal transfer of multiple antimalarial antibodies in Mozambican women.
S Alonso; M Vidal; G Ruiz-Olalla; G Moncunill.
Journal of Infection. 2021; 82-4, pp.45-57.
DOI: 10.1016/j.jinf.2021.02.024
Highly Sensitive and Specific Multiplex Antibody Assays To Quantify Immunoglobulins M, A, and G against SARS-CoV-2 Antigens.
C Dobaño; M Vidal; R Santano; G Moncunill.
Journal of Clinical Microbiology. 2021; 59-2.
DOI: 10.1128/JCM.01731-20
Seven-month kinetics of SARS-CoV-2 antibodies and role of pre-existing antibodies to human coronaviruses.
N Ortega; M Ribes; M Vidal; C Dobaño.
Nature Communications. 2021; 12-1, pp.4740.
DOI: 10.1038/s41467-021-24979-9
Antibody responses to the RTS,S/AS01E vaccine and Plasmodium falciparum antigens after a booster dose within the phase 3 trial in Mozambique.
L Sánchez; M Vidal; C Jaroice; C Dobaño.
NPJ Vaccines. 2020; 5, pp.46.
DOI: 10.1038/s41541-020-0192-7
A Balanced Proinflammatory and Regulatory Cytokine Signature in Young African Children Is Associated With Lower Risk of Clinical Malaria.
C Dobaño; AJ Nhabomba; MN Manaca; PL Alonso.
Clinical Infectious Diseases. 2019; 69-5, pp.820-828.
DOI: 10.1093/cid/ciy934

CENTRO

ISGLOBAL - Institut de Salut Global de Barcelona

Rosselló, 132, 6ª planta

08036 Barcelona http://www.isglobal.org/ca/

ÁMBITOS RIS3CAT

  • Sistema educativo y de generación de conocimiento
  • Sistema sociosanitario

CATEGORÍAS

  • ENSAYOS CLÍNICOS
  • EQUIPAMIENTO TECNOLÓGICO
    • Metabolómica
    • Secuenciación

TARIFAS Y ACCESO

Nivel de disponibilidad: Alta
Procedimiento de Acceso:
Abierto. Contacta con Ruth Aguilar (ruth.aguilar@isglobal.org) para solicitar un servicio y pedir un presupuesto.
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