Respuesta inmune y biomarcadores
GINYS-ISGLOBAL-004
Carrer Roselló 153 (CEK building, 1st floor)
E-08036 Barcelona, Catalonia, Spain
E-08036 Barcelona, Catalonia, Spain
Esta Plataforma ofrece como servicio la cuantificación de un amplio panel de biomarcadores mediante diferentes tecnologías como ELISAs, x-MAP Luminex y OLINK (laboratorio CORE certificado internacionalmente), en diversos bio-especímenes. Los biomarcadores perfilados son principalmente proteínas, e incluyen anticuerpos de diferentes isotipos y subclases frente a paneles customizados de antígenos y otros marcadores inmunológicos como las citocinas, quimiocinas y factores de crecimiento. También podemos medir biomarcadores relacionados con otros procesos fisiológicos como metabólicos, neurológicos, cardiovasculares, etc.
Entre los aspectos más destacados de la Plataforma se encuentran: i) la capacidad de medir varios analitos multiplexados, obteniendo información multiparamétrica a partir de muestras únicas en Luminex y Olink, ii) la miniaturización, ideal para volúmenes de muestra pequeños (ej. estudios con muestras de cohortes pediátricas), iii) la versatilidad y adaptabilidad a las necesidades (los kits pueden ser comerciales o producidos internamente), iv) el alto rendimiento (equipo semiautomatizado de manipulación de líquidos), v) la capacidad de medir la funcionalidad de los anticuerpos (ej. inhibición de la unión, ensayos de neutralización) y vi) la complementariedad de técnicas (ej. Luminex frente a Olink para citocinas y otros biomarcadores).
En nuestros paneles usamos proteínas recombinantes comerciales o producidas internamente en sistemas de expresión procariota o eucariota, y anticuerpos monoclonales (mAbs), para aplicaciones personalizadas. Adicionalmente podemos analizar el fenotipo de células del sistema inmune mediante citometría de flujo, y las respuestas antígeno-específicas de linfocitos T mediante tinción intracelular de citocinas (ICS) y mediante ensayos para medir marcadores de linfocitos T inducidos por activación (AIM) mediante citometría de flujo y ensayos de ELIspot/FluoroSpot.
Entre los conocimientos y capacidades específicos que se ofrecen como valores añadidos se incluyen la amplia experiencia del grupo y su la larga trayectoria en monitorización inmune, el desarrollo de programas específicos de control de calidad (QA/QC) y preprocesamiento de los datos, y la posibilidad de realizar análisis estadísticos, consultoría, formación y desarrollo de capacidades, incluido para el personal de laboratorio de países de renta media y baja.
Servicios
– Ensayos ELISA y colorimétricos utilizando kits comerciales o desarrollados internamente para medir concentración de diferentes analitos.
– Ensayos multiplex de citocinas mediante Luminex utilizando kits comerciales para medir concentración de proteínas como citocinas, quimiocinas, factores de crecimiento u otras, y expresión génica mediante Invitrogen™ QuantiGene™ Plex.
– Ensayos multiplex de anticuerpos mediante Luminex desarrollados por nuestro grupo para medir niveles y avidez de IgG, IgM, IgA IgA1, IgA2, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgE frente paneles flexibles de antígenos de diferentes microbios.
– Ensayos multiplex de anticuerpos funcionales mediante Luminex.
– Ensayos Olink utilizando kits comerciales para medir niveles de hasta 92 biomarcadores en formato multiplex (T96, T48 y 21-Flex) (CoreLab Certificado Internacionalmente: https://olink.com/products-services/sample-analysis-service/external-service-providers/)
– Otros ensayos celulares (linfocitos T y B) según requerimiento (citometría de flujo, ELIspot/FluoroSpot)
Para estas tecnologías ofrecemos:
a) Asesoramiento sobre qué marcadores, tecnologías (ELISA, Luminex, Olink) y kits utilizar según el objetivo y especificidades del estudio
b) Diseño de experimentos
c) Contactos proveedores y preparación de presupuestos
d) Compra de los reactivos y kits
e) Realización de los ensayos
f) QA/QC de los datos generados
g) Pre-procesamiento de los datos
h) Preparación del informe de resultados. Opción de análisis estadístico de los datos.
i) Asesoramiento en la interpretación de los resultados
j) Adicionalmente: Formación y capacity building en preprocesamiento y análisis de los datos, incluido para el personal de laboratorio de países de ingresos medios y bajos.
k) Adicionalmente: Expresión de proteínas y anticuerpos monoclonales para proporcionar a clientes o para realizar ensayos de anticuerpos antígeno-específicos (customizado)
m) Adicionalmente: Citometría de flujo y ELIspot/FluoroSpot (adquisición/lectura de muestras usando instrumentos de la plataforma IDIBAPS)
Equipos
– Lector de ELISAs (EPOCH2, BioTek)
– Dos lavadores automaticos (BioTek)
– Instrumentos Luminex: un Magpix, un Luminex 100/2002 y dos FlexMap3D
– Accesorios para los ensayos Luminex:
- Kingfisher Flex 96 deepwell (Thermo Fisher) para el acoplamiento automatizado de antígenos a las microesferas
- Integra Assist Plus e Integra Viaflo 384 (Integra) para la manipulación de líquidos en placas de 384 pocillos
- Dos agitadores orbitales de placas de 96 pocillos (Thermo Fisher)
- Dos agitadores orbitales de placas de 384 pocillos (Heidolph Titramax: https://www.milian.com/product/0O-43-20?language=en)
– Guava easyCyte para contaje automático de células y microesferas
– OLINK Signature 100
– Accesorios para los ensayos OLINK:
- Signature Q100 Interface plate: 96.96, 48.48 and 24.192
- Centrifuga para placas (Eppendorf (5430/5430R))
- Microcentrifuga para strips y tubos (IKA Mini G Centrifuge, Fisher Scientific)
- Vortex de placas (MaxMate Eppendorf 230V Version)
- Bloque para placas (MixMate PCR 96 tube holder, Eppendorf)
- Pipetas simples y multicanal de precisión (Rainin, Mettler Toledo)
- Bloc de frio (-20ºC) para trabajar con enzimas
- Termociclador (SimpliAMP Thermal cycler, Applied Biosystems)
– Acceso a la plataforma de citometría de IDIBAPS (FACS FORTESSA 4 y 5 lasers, Aurore Cytek Cytometry)
– Softwares para ejecutar ELISA (GraphPad Prism), Luminex (X-ponent 4.3), Olink (NPX Signature software: https://olink.com/products-services/data-analysis-products/olink-npx-signature/), y citometría de flujo (FlowJo)
Personal
Ruth Aguilar | ruth.aguilar@isglobal.org
| ORCID
Marta Vidal | marta.vidal@isglobal.org
| ORCID
Felipe Raimondi | felipe.raimondi@isglobal.org
Cèlia Torres | celia.torres@isglobal.org
Proyectos
Título:
ATHLETE - Advancing Tools for Human Early Lifecourse Exposome Research and Translation
Referencia:
https://www.isglobal.org/ca/-/athlete
Organismo financiador:
EU-H2020
Estado:
Activo
Título:
BISC - Barcelona Life Study Cohort
Referencia:
http://www.biscproject.org
Organismo financiador:
EIC-HEI
Estado:
Acabado
Título:
COVICAT - Cohorte Covid-19 en Cataluña
Referencia:
https://www.isglobal.org/ca/-/covicat
Organismo financiador:
CERCA, EIT-Health,”la Caixa” Social Research grant SR20-01024
Estado:
Activo
Título:
EPHOR - Exposome Project for Health and Occupational Research
Referencia:
https://www.ephor-project.eu/
Organismo financiador:
EU-TNO (NED)
Estado:
Activo
Título:
EChiLiBRiST - Development and validation of a quantitative point-of-care test for the measurement of severity biomarkers to improve risk stratification of fever syndromes and enhance child survival
Organismo financiador:
EU-HE
Estado:
Activo
Título:
Baseline host and environmental factors that impact pre-erythrocytic malaria vaccine (hypo)responsiveness in endemic regions
Organismo financiador:
NIAID-NIH( USA) et al.
Estado:
Activo
Título:
END-VOC - Ending COVID-19 variants of concern through cohort studies
Referencia:
HORIZON-HLTH-2021-CORONA-01-02
Organismo financiador:
EU-HE
Estado:
Activo
Título:
INCENTIVE - Indo-European Consortium for next generation influenza vaccine innovation
Organismo financiador:
EU-H2020
Estado:
Activo
Título:
Impact of coinfections on the balance of antibody and T helper responses to antigen targets of naturally-acquired and vaccine immunity to major human pathogens
Organismo financiador:
ISCIII
Estado:
Acabado
Título:
Infection acquisition in early life and health outcomes in childhood
Referencia:
https://www.isglobal.org/ca/-/subclinical-infections-in-children-and-long-term-health-effects
Organismo financiador:
Maratò TV3
Estado:
Acabado
Título:
CoViproteHCt - Identifying protective immunity to SARS-CoV-2 in Health Care Personnel
Organismo financiador:
EIT Health
Estado:
Acabado
Título:
ANTICOV-IMMUNO -The impact of COVID-19 treatment on the type, strength and duration of antibody and cellular immune responses in SARS-CoV-2 patients in sub-Saharan Africa
Organismo financiador:
UNITAID
Estado:
Acabado
Publicaciones
Evaluation of the accuracy of a multi-infection screening test based on a multiplex immunoassay targeting imported diseases common in migrant populations.
Travel Med Infect Dis. 2023 Dec 21;57:102681.
Travel Med Infect Dis. 2023 Dec 21;57:102681.
Individual blood concentrations of persistent organic pollutants and chemical elements, and COVID-19: A prospective cohort study in Barcelona.
Enviromental Research 2023; 223
Enviromental Research 2023; 223
Long-Term Exposure to Air Pollution and COVID-19 Vaccine Antibody Response in a General Population Cohort (COVICAT Study, Catalonia).
Environ Health Perspectives. 2023; 131-4, pp.4700
Environ Health Perspectives. 2023; 131-4, pp.4700
RBD-Based ELISA and Luminex Predict Anti-SARS-CoV-2 Surrogate-Neutralizing Activity in Two Longitudinal Cohorts of German and Spanish Health Care Workers.
Microbiol Spectrum. 2023; 14-11(1), pp.e0316522.
Microbiol Spectrum. 2023; 14-11(1), pp.e0316522.
Evaluation of antibody serology to determine current helminth and Plasmodium falciparum infections in a co-endemic area in Southern Mozambique.
PLoS Neglected Tropical Diseases. 2023; 16-6, pp.e0010138.
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SARS-CoV-2 infection, vaccination, and antibody response trajectories in adults: a cohort study in Catalonia.
BMC Medicine. 2022; 20-1, pp.347.
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Antibody conversion rates to SARS-CoV-2 in saliva from children attending summer schools in Barcelona, Spain.
BMC Medicine. 2021; 19-1, pp.309.
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HIV infection and placental malaria reduce maternal transfer of multiple antimalarial antibodies in Mozambican women.
Journal of Infection. 2021; 82-4, pp.45-57.
Journal of Infection. 2021; 82-4, pp.45-57.
Highly Sensitive and Specific Multiplex Antibody Assays To Quantify Immunoglobulins M, A, and G against SARS-CoV-2 Antigens.
Journal of Clinical Microbiology. 2021; 59-2.
Journal of Clinical Microbiology. 2021; 59-2.
Seven-month kinetics of SARS-CoV-2 antibodies and role of pre-existing antibodies to human coronaviruses.
Nature Communications. 2021; 12-1, pp.4740.
Nature Communications. 2021; 12-1, pp.4740.
Antibody responses to the RTS,S/AS01E vaccine and Plasmodium falciparum antigens after a booster dose within the phase 3 trial in Mozambique.
NPJ Vaccines. 2020; 5, pp.46.
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A Balanced Proinflammatory and Regulatory Cytokine Signature in Young African Children Is Associated With Lower Risk of Clinical Malaria.
Clinical Infectious Diseases. 2019; 69-5, pp.820-828.
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