Genómica
GINYS-CRG-005
El CRG Genomics Core Facility se estableció en 2008 y actualmente admite tecnologías de secuenciación de nueva generación.
Desde su fundación, el CRG ha realizado importantes inversiones en genómica, incluida la compra de diversos instrumentos de secuenciación de nueva generación. Se han implementado diversas tecnologías de alto rendimiento para evaluar la expresión diferencial, la variación genética interindividual, el descubrimiento de microRNA, la secuenciación del genoma, la secuenciación dirigida, el perfil epigenético y la identificación de sitios de unión de ADN o proteínas asociadas a ARN.
Servicios
El campo de la secuenciación ha experimentado un importante cambio con la introducción de tecnologías innovadoras de secuenciación de alto rendimiento. La Unidad de Genómica del CRG está actualmente equipada con la tecnología de secuenciación Illumina.
El servicio de secuenciación se ofrece en CRG, PRBB y usuarios externos. Realizamos ChIP-Seq, mRNA-Seq, secuenciación de pequeñas moléculas de ARN tales como miRNA, secuenciación de amplicones, resecuenciación del genoma y secuenciación de novo.
A partir de muestras de ADN o ARN que nos proporcionan, el servicio incluye:
- Preparación de la biblioteca de secuenciación incl. conexión de adaptadores específicos de plataforma
- Control de calidad de la biblioteca
- Cuantificación bibliográfica
- Realización de la secuenciación
- Datos de llamada base, control de calidad de datos de secuencia, puesta a disposición de los datos (archivos de secuencias, archivos de calidad, archivos de alineación)