Citometría

GINYS-IGTP-002
Marco Antonio Fernández Sanmartín
Responsable

Plataforma de Citometria
Planta Baixa IGTP Edifici Mar
Institut de Recerca Germans Trias i Pujol (IGTP)
Crta. de Can Ruti – camí de les escoles, s/n
08916 Badalona, Barcelona, Spain

La plataforma de Citometría fue creada en 1999 como servicio de apoyo a la investigación dentro del Instituto de Investigación Germans Trias i Pujol, en el campus Can Ruti, en Badalona. Adicionalmente, también da servicio de diagnóstico clínico en Inmunología en el Hospital Germans Trias i Pujol e imparte anualmente cursos de formación en citometría de flujo. La plataforma proporciona servicios de separación celular, análisis y adquisición en citómetro de flujo analizador, consultoría y formación. Desde febrero de 2006, la plataforma de Citometría se ubica en la planta baja del edificio Mar del IGTP. Consta de 64 m2, distribuidos en un laboratorio exclusivo por el uso del separador celular y un espacio dedicado a los citómetros de flujo analizadores, así como una zona de ordenadores para análisis off-line.

Servicios

Separació cel·lular

Els citòmetres de flux separadors (FACSAria II) permeten separar cèl·lules en funció de paràmetres prèviament definits per l’operador. Per a purificar diferents poblacions cel·lulars, la citometria de flux està especialment dissenyada per aplicacions que requereixin una alta puresa de recol·lecció. La utilització de múltiples fluorocroms simultàniament permet classificar i separar subpoblacions cel·lulars en funció de l’expressió de diferents propietats cel·lulars.

La preparació de l’experiment de separació cel·lular exigeix una sèrie de passos previs a la seva realització que s’han de concretar amb antelació amb el responsable de la Plataforma de Citometria.

Adquisición y análisis con citómetro de flujo analizador

BD FACSCanto II, BD FACSLyric y BD LSR Fortessa son los citómetros analizadores de los que el usuario puede disponer para realizar diferentes estudios. Estos equipos pueden ser utilizados directamente por el usuario, ya sea acreditando experiencia en el manejo de estos equipos o mediante curso previo por parte del personal de la plataforma de Citometría. Adicionalmente, puede utilizarse el separador celular FACSAria II como citómetro analizador, sobre todo en casos de necesidad de uso de más detectores de fluorescencia.

Análisis offline en entorno Mac/Windows con software FACSDiva y FlowJo, compensación offline y escalas «Logicle» o biexponenciales y ModFit.

Formación

Diseño de cursos personalizados. Anualmente se realizan en el IGTP varios cursos sobre fundamentos y aplicaciones en citometría de flujo.

Consultoría

La plataforma de Citometría pone a disposición de los usuarios un servicio de consultoría en cuestiones relacionadas con la citometría de flujo.

Equipos

Separació Cel·lular
  • Separador Celular FACSAria II (BD Biosciences)

Tres láseres (405, 488 y 633 nm), quince detectores (trece fluorescencias y dos parámetros de dispersión de luz). ACDU (Automated Cell Deposition Unit) para separación en distintos tipos de placas de pozos y slides; opción single cell. Opciones instaladas: sistema de evacuación de aerosoles (AMO) y control de temperatura por baño refrigerado. Software FACSDiva.

  • Citómetros de flujo analizadores
  • Citómetro de Flujo LSRFortessa SORP (BD Biosciences)

Equipado con láser azul de estado sólido (488nm), láser rojo He-Ne (640 nm), láser violeta (405 nm) y láser verde (532 nm), permite trabajar con 18 fluorescencias y 2 parámetros de racimo (FSC y SSC ), analizando para cada uno el área, altura y anchura del pulso eléctrico. Procesamiento de señales digitales, adquisición y análisis con software FACSDiva. Sistema HTS por la adquisición de muestras con placas de 96 pozos.

  • Separador Celular FACSLyric (BD Biosciences)

Equipado con láser azul de estado sólido (488nm), láser rojo He-Ne (633nm) y láser violeta (405nm), permite trabajar con diez fluorescencias y dos parámetros de racimo (FSC y SSC). Sistema de procesamiento de señales digital con software BD FACSSuite. Equipado con cargador de muestras automatizado para tubos y placas de 96 pozos.

  • Citómetro de Flujo FACSCanto II (BD Biosciences)

Equipado con láser azul de estado sólido (488nm), láser rojo He-Ne (633nm) y láser violeta (405nm), permite trabajar con ocho fluorescencias y dos parámetros de racimo (FSC y SSC). Sistema de procesamiento de señales digital con software FACSDiva. Equipado con cargador de muestras automatizado por tubos (Loader).

  • Luminex® 200 (Luminex Corp.)

El sistema Luminex® 200 es un analizador basado en los principios de citometría de flujo. Luminex® 200 establece el estándar para la multiplexación y ofrece la capacidad de realizar hasta 100 pruebas diferentes en un solo volumen de reacción y utilizar beads magnéticos o de poliestireno. Obtiene un gran rendimiento de muestra con un tiempo de lectura de placa de 96 jarras de sólo 45 minutos.

Programas para análisis off-line

Software

FlowJo, FACSDiva y CellQuestPro instalado en un ordenador iMac 27″ Intel i7 16 GB RAM con sistemas MAC OSX y Windows (XP y 7).

Citometría espectral de alta dimensión

Aurora 5-láser (Cytek Biosciences)

Instalado en mayo de 2020, está configurado con cinco láseres (355, 405, 488, 561 y 640 nm), tres parámetros de racimo y 64 canales de fluorescencia. Aurora permite datos de alta dimensión con paneles diseñados (40 colores simultáneamente y más allá). Equipado con un sistema automático de micromuestreo (AMS) para la adquisición de alto rendimiento con placas de 96 pozos. Análisis de datos con el software SpectroFlo para diferenciar datos raw data espectrales.

Personal

Responsable
Marco Antonio Fernández Sanmartín | mafernandez@igtp.cat | 930 330 522

Publicaciones

High-Dimensional Immunophenotyping with 37-Color Panel Using Full-Spectrum Cytometry
Marco A Fernandez, Hammad Alzayat, Maria C Jaimes, Yacine Kharraz, Gerard Requena, Pedro Mendez
Methods Mol Biol. 2022;2386:43-60.

CENTRO

IGTP - Institut d'Investigació en Ciències de la Salut Germans Trias i Pujol

Edifici Mar
Ctra. de Can Ruti,
Camí de les escoles, s/n

08916 Badalona http://www.germanstrias.org/ca-index/

ÁMBITOS RIS3CAT

  • Sistema educativo y de generación de conocimiento
  • Sistema industrial
  • Sistema sociosanitario

CATEGORÍAS

  • EQUIPAMIENTO TECNOLÓGICO
    • Citometría

TARIFAS Y ACCESO

Nivel de disponibilidad: Media
Procedimiento de Acceso:

Abierto

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