Plataforma de interacciones moleculares
GINYS-IDIBELL-006
La Plataforma de Interacciones Moleculares proporciona apoyo científico-tecnológico a la comunidad científica en el campo de las interacciones moleculares y biomarcadores utilizando varios enfoques. En primer lugar, Surface Plasmon Resonance (SPR) permite la monitorización en tiempo real de cualquier tipo de interacciones moleculares (proteína-proteína, proteína-fármacos, proteína-vesículas, proteína-ARN,…) y realiza mediciones de alta precisión de las constantes de afinidad y cinéticas, la especificidad de unión, isotipado y cribado de posibles medicamentos / fármacos. A continuación, la tecnología Luminex permite la detección de hasta cincuenta biomarcadores diferentes a la vez en muestras biológicas y fluidos utilizando la tecnología de perlas magnéticas. Además, el metabolismo y la bioenergética, que controlan funciones celulares como la señalización celular, la proliferación o el destino celular, pueden ser medidos mediante el Seahorse en tiempo real en células vivas. La respiración mitocondrial, la glucólisis, la tasa de oxidación de ATP y la oxidación de ácidos grasos se pueden medir con alta precisión.
Recientemente hemos adquirido una plataforma de transcriptómica y proteómica espacial de alta resolución, CosMx (Nanostring). CosMx SMI permite la rápida cuantificación y visualización de hasta 6.000 ARN y 64 analitos proteicos validados a resolución unicelular en biopsias y muestras de tejidos.
Nuestra misión es ofrecer un soporte integrado, desde el diseño experimental, la optimización de las condiciones del ensayo, la ejecución de experimentos hasta el análisis de datos y la generación de informes. Nuestra tecnología punta junto con la gran experiencia y conocimiento en investigación biomédica y ciencia de proteínas están al servicio de investigadores internos y externos
Servicios
- Transcriptómica y proteómica espacial a resolución de célula única mediante la plataforma CosMx (Nanostring). Paneles de 6000-ARN, 1000- ARN o 64-proteinas en formato de 2- o 4- portas.
- Determinación de la constante de afinidad (KD), cinética: constantes de asociación y disociación (kon, koff) en diferentes modelos. Determinación de la concentración efectiva y control de calidad. Isotipado de anticuerpos. Cribado de posibles fármacos / biosimilares
- Cuantificación ultrasensible de hasta 4 biomarcadores immunológicos y neuronales en fluidos biológicos en placas de 96 (SIMOA, Quanterix)
- Cuantificación de hasta 50 biomarcadores en muestras y fluidos biológicos en placa de 96 pocillos por Luminex
- Medida de la tasa de consumo de oxígeno (OCR) y la tasa de acidificación extracelular (ECAR) en placa de 96 pocillos (Seahorse): respiración mitocondrial, glucólisis, producción de ATP, lipólisis
- Escaneo fluorescente de varios formatos
- Diseño experimental, configuración y optimización de condiciones experimentales
- Apoyo científico-tecnológico a investigadores
- Capacitación de nuevos usuarios en el uso del equipo.
Equipos
- CosMx Spatial Multiomics Single-Cell Imaging Platform (Nanostring)
- SIMOA SR-X Ultra-sensitive biomarker detection (Quanterix)
- Biacore T-200 (GE) para análisis SPR de interacciones
- Analizador Seahorse XFe96 (Agilent) para la detección de OCR y ECAR en una placa de 96 pocillos
- Magpix (Luminex) que incluye software xPonent 4.2 para análisis multiplex de hasta 50 perlas magnéticas
- Escáner de fluorescencia Typhoon FLA9500 (GE) equipado con láser azul, verde y rojo
- Software ImageQuant TL 7.0
Personal
Silvia Barceló | molecularinteractions@idibell.cat
Publicaciones
SIRT6-dependent cysteine monoubiquitination in the PRE-SET domain of Suv39h1 regulates the NF-kB pathway.
Nature communications, 2018, 9:101
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KAT6B is a tumor suppressor histone H3 lysine 23 acetyltransferase undergoing genomic loss in small cell lung cancer.
Cancer Research 2015, 75, 3936-3945
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Integration of DIGE and bioinformatics analyses reveals a role of the anti-obesity agent tungstate in redox and energy homeostasis pathways in brown adipose tissue.
Molecular and Cellular Proteomics, 2008, 7, 378-393
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